垂体神经内分泌肿瘤是颅内常见的肿瘤类型之一，其各亚型特征由不同的转录因子定义。尽管免疫细胞在PitNETs中的作用已被广泛认可，但对于不同亚型PitNETs的细胞分子特征及其肿瘤免疫微环境特点，之前缺乏系统性的描述。本研究纳入了365例PitNETs的转录组样本、23例单细胞样本和1例空间样本，以及128例免疫组化和45例流式染色用于验证，覆盖了PIT-1、T-PIT、SF-1三种谱系。通过对23例单细胞样本的分析，研究人员首先描绘了PitNETs的单细胞图谱，明确了上皮细胞、基质细胞和免疫细胞在三个谱系中的分布，并分析了它们之间差异表达的基因和相关通路。结合单细胞数据与365例转录组数据，将垂体瘤分为6个亚型G1-G6，目前G1-G3为PIT-1谱系；G4-G5为T-PIT谱系；G6为SF-1谱系；并识别出PitNETs中不同谱系具有高、中、低三型肿瘤免疫微环境，尤其发现G1和G4免疫高浸润；而G6亚型免疫低浸润。

进一步，通过分析免疫细胞中肿瘤相关巨噬细胞（TAM）的亚群，识别出五群TAM，分别为LYVE1+、ISG15+、GPNMB+、C1Q+、CX3CR1+ TAM；其中GPNMB+、C1Q+、CX3CR1+ TAM分别在PIT-1、T-PIT、SF-1谱系的PitNETs中富集。这三类巨噬细胞功能分析发现C1Q+ TAM在TPIT 系支持蛋白质合成的核糖体信号通路，可能有助于维持激素分泌的增加；GPNMB+ TAM在POU1F1系可能提供能量和物质的氧化磷酸化途径。CX3CR1+ TAM在SF1系通过转化生长因子β（TGF-β）的负调控途径，有助于调控肿瘤生长。LYVE1+ TAM则偏向巨噬细胞分化的中间态，受不同谱系微环境的调控；最后，我们通过空间转录组等实验方法验证了CX3CR1+ TAM的配体受体对，在体内与体外验证CX3CR1+TAM通过INHBA-ACVR1B轴调节SF1谱系肿瘤细胞凋亡，有望作为后续治疗的靶点。

过去，没有文献对PitNETs的免疫全景进行描述。该研究首次采用多组学，结合大样本数据，系统阐述PitNETs的免疫全景图，并针对TAMs的分类，深入探究TAMs与肿瘤细胞之间特定的相互作用。确定这些相互作用轴，不仅增加了我们对PitNETs中免疫微环境复杂性的理解，而且揭示了免疫疗法在治疗PitNETs中的潜力，有望成为治疗的新策略。

该论文的共同第一作者是上海交通大学附属瑞金医院神经外科医师林绍坚、瑞金医院转化医学国家重大科技基础设施（上海）副研究员代雨婷、上海交通大学医学院博士生韩长熹、硕士生韩天怡。共同通讯作者是上海交通大学医学院上海市免疫所免疫与微生物学系研究员沈蕾、上海市免疫所肿瘤微环境与肿瘤免疫课题组长叶幼琼、上海交通大学附属瑞金医院神经外科副研究员薛礼和上海交通大学附属瑞金医院神经外科主任医师吴哲褒。