法国古斯塔夫•鲁西癌症研究中心儿童和青少年肿瘤科的Léa Guerrini-Rousseau等分析HGG-MYCN亚型患者体细胞和生殖细胞中TP53突变与DNA甲基化谱。结果发表在2023年1月的《Acta Neuropathol Commun》在线。
——摘自文章章节
【Ref: Guerrini-Rousseau L, et al. Acta Neuropathol Commun. 2023 Jan 6;11(1):3. doi: 10.1186/s40478-022-01490-w.】
研究背景
在2021年中枢神经系统肿瘤的WHO分类中,儿童高级别胶质瘤(high-grade gliomas,HGGs),IDH和H3野生型(WT)可分为以下三个分子亚型:RTK1、RTK2和MYCN。HGG-MYCN型具有复发的组织特性(胚胎样的结节细胞)、基因特性(高频MYCN和ID2扩增,体细胞TP53突变)和特定的DNA甲基化谱。李-佛美尼综合征(Li-Fraumeni syndrome,LFS)是癌症的一个分类病症,囊括多种原发脑肿瘤。LFS与HGG-MYCN亚型是否存在一定的关联?法国古斯塔夫•鲁西癌症研究中心儿童和青少年肿瘤科的Léa Guerrini-Rousseau等分析HGG-MYCN亚型患者体细胞和生殖细胞中TP53突变与DNA甲基化谱。结果发表在2023年1月的《Acta Neuropathol Commun》在线。
研究方法

研究结果
7例患者中,4例(57%)有致病性TP53种系突变,甲基化肿瘤分类有较高的校准评分。但并不是所有患者都有家族遗传史或癌症易感相关因素。在家族遗传咨询中,1例患者表现出全新的PV,另1例的祖父有恶性肉瘤家族史,正在分析其父母的遗传因子。未观察到其余病例的TP53种系突变。基于表观遗传学证实HGG-MYCN患者中,体细胞TP53 PV的高患病率(作者的研究系列为100%,最初的甲基化分类研究为67%),作者认为HGG-MYCN与LFS相关,并揭示其可能构成这种遗传易感性综合征的模式。与无TP53种系突变的患者相比,LFS患者在基于DNA甲基化的CNS肿瘤分类中似乎没有形成独特的亚群。虽然MYCN扩增和TP53 PV在HGG-MYCN中富集,但这些改变不是该亚组所特有,也可能见于其它儿童HGGs亚型(RTK1, RTK2)。在该研究系列中,1例归类于儿童HGGs未特指A亚型患者(具高校准评分)经t-SNE分析,聚在HGG-MYCN附近。该结果表明,儿童HGGs的所有亚型(基于甲基化分类出的8种类型)之间的表观遗传界限仍需进一步细分,并可能认为Korshunov等定义的三个初始亚群(尤其是不伴有MYCN扩增和TP53突变的HGG-MYCN患者)可能将在其它甲基化类别中重新定义。
研究结论
对于所有证实HGG-MYCN存在TP53体细胞突变的患者,都应进行TP53构成分析和遗传咨询。需要更多的病例来确定与LFS相关的HGG-MYCN是否与没有TP53种系突变的患者形成不同的甲基化亚类。同时,还需要进一步的研究确定儿童肿瘤的临床、具有胚胎特征的HGG组织病理学和TP53 PV和MYCN扩增的遗传特征是否可以通过DNA甲基化扩展作为HGGs的替代诊断标准。
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