2023年03月20日发布 | 685阅读
肿瘤
小儿

儿童HGGs的MYCN亚型常伴有Li-Fraumeni综合征

颜华

广东省梅州市人民医院

邱天明

复旦大学附属华山医院

法国古斯塔夫•鲁西癌症研究中心儿童和青少年肿瘤科的Léa Guerrini-Rousseau等分析HGG-MYCN亚型患者体细胞和生殖细胞中TP53突变与DNA甲基化谱。结果发表在2023年1月的《Acta Neuropathol Commun》在线。


——摘自文章章节


Ref: Guerrini-Rousseau L, et al. Acta Neuropathol Commun. 2023 Jan 6;11(1):3. doi: 10.1186/s40478-022-01490-w.


研究背景



在2021年中枢神经系统肿瘤的WHO分类中,儿童高级别胶质瘤(high-grade gliomas,HGGs),IDH和H3野生型(WT)可分为以下三个分子亚型:RTK1、RTK2和MYCN。HGG-MYCN型具有复发的组织特性(胚胎样的结节细胞)、基因特性(高频MYCN和ID2扩增,体细胞TP53突变)和特定的DNA甲基化谱。李-佛美尼综合征(Li-Fraumeni syndrome,LFS)是癌症的一个分类病症,囊括多种原发脑肿瘤。LFS与HGG-MYCN亚型是否存在一定的关联?法国古斯塔夫•鲁西癌症研究中心儿童和青少年肿瘤科的Léa Guerrini-Rousseau等分析HGG-MYCN亚型患者体细胞和生殖细胞中TP53突变与DNA甲基化谱。结果发表在2023年1月的《Acta Neuropathol Commun》在线。


研究方法



作者基于组织病理学和MYCN扩增从151例儿童HGGs患者中筛选出11例HGG-MYCN亚型患者。在这11例患者中,免疫组织化学均表现出p53过表达,并具有体细胞TP53致病变体(pathogenic variant,PV)。7例儿童HGG-MYCN患者中,有5例患者样本可匹配纳入DNA甲基化分类组,其校准的分类值大于0.9。另外2例为HGG未特指型(其中1例HGG-MYCN,校准分值为0.2)。进一步无监督t-SNE分析发现,所有患者均聚集在HGG-MYCN内或附近(图1)。


图1. t-SNE分析肿瘤的DNA甲基化片段和参考样本。DNA甲基化参考分类:具有毛样特征的高级星形细胞瘤(ANA PA)、弥漫性高级别胶质瘤,伴H3.3 G34突变体(DHG H3 G34)、弥漫性中线胶质瘤H3 K27M突变体(DMG H3 K27)、儿童胶质母细胞瘤(IDH野生型,MYCN亚类)、儿童胶质母细胞瘤IDH野生型非特指A型(GB ped NOS A)、未特指B型(GB ped NOS B)、RTK1a类(GB ped RTK1a)、RTK1b类(GB ped RTK1b)、RTK1c类(GB ped RTK1c)、RTK2a类(GB ped RTK2a)、RTK2b类(GB ped RTK2b)、婴儿型大脑半球胶质瘤、大脑半球毛细胞星形细胞瘤、幕下毛细胞星形细胞瘤(PA INF)、中线毛细胞星形细胞瘤(PA MID)和多形性黄色星形细胞瘤(PXA)。

研究结果



7例患者中,4例(57%)有致病性TP53种系突变,甲基化肿瘤分类有较高的校准评分。但并不是所有患者都有家族遗传史或癌症易感相关因素。在家族遗传咨询中,1例患者表现出全新的PV,另1例的祖父有恶性肉瘤家族史,正在分析其父母的遗传因子。未观察到其余病例的TP53种系突变。基于表观遗传学证实HGG-MYCN患者中,体细胞TP53 PV的高患病率(作者的研究系列为100%,最初的甲基化分类研究为67%),作者认为HGG-MYCN与LFS相关,并揭示其可能构成这种遗传易感性综合征的模式。与无TP53种系突变的患者相比,LFS患者在基于DNA甲基化的CNS肿瘤分类中似乎没有形成独特的亚群。虽然MYCN扩增和TP53 PV在HGG-MYCN中富集,但这些改变不是该亚组所特有,也可能见于其它儿童HGGs亚型(RTK1, RTK2)。在该研究系列中,1例归类于儿童HGGs未特指A亚型患者(具高校准评分)经t-SNE分析,聚在HGG-MYCN附近。该结果表明,儿童HGGs的所有亚型(基于甲基化分类出的8种类型)之间的表观遗传界限仍需进一步细分,并可能认为Korshunov等定义的三个初始亚群(尤其是不伴有MYCN扩增和TP53突变的HGG-MYCN患者)可能将在其它甲基化类别中重新定义。


研究结论



对于所有证实HGG-MYCN存在TP53体细胞突变的患者,都应进行TP53构成分析和遗传咨询。需要更多的病例来确定与LFS相关的HGG-MYCN是否与没有TP53种系突变的患者形成不同的甲基化亚类。同时,还需要进一步的研究确定儿童肿瘤的临床、具有胚胎特征的HGG组织病理学和TP53 PV和MYCN扩增的遗传特征是否可以通过DNA甲基化扩展作为HGGs的替代诊断标准。


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