随着对分子亚型特征进一步认识,德国海德堡癌症协会的Sebastian Adeberg等对临床获取的GBM样本,采用DNA甲基化分析法,开展脑室下区GBM新分类法的研究,结果发表于2022年6月的《Acta Neuropathologica》在线。
——摘自文章章节
【Ref: Adeberg S, et al. Acta Neuropathol. 2022 Jul;144(1):129-142. doi: 10.1007/s00401-022-02443-2. Epub 2022 Jun 4.】
研究背景
胶质母细胞瘤(GBM)是恶性程度最高的脑肿瘤,其浸润性生长和抵抗治疗,不可避免地导致治疗失败和预后不良。研究表明,脑室下区(SVZ)部位的GBM预后不良,当前GBM分类主要依赖于MRI成像所获取的影像学数据,但观察者之间的高变异性和缺乏客观标准,一定程度上限制分类的准确性。随着对分子亚型特征进一步认识,德国海德堡癌症协会的Sebastian Adeberg等对临床获取的GBM样本,采用DNA甲基化分析法,开展脑室下区GBM新分类法的研究,结果发表于2022年6月的《Acta Neuropathologica》在线。
研究方法
该研究纳入海德堡大学医院收治的54例异柠檬酸脱氢酶-1(IDH1)野生型的患者,根据MRI成像所示对脑室下区肿瘤位置进行影像学评估,并结合临床信息分类与匹配,对肿瘤样本做DNA提取和甲基化分析;随后通过TCGA数据库验证和临床结果生存分析法研究,建立基于DNA-甲基化辅助下的脑室下区GBM新分类方法。
研究结果
研究结果展示,成功构建DNA-甲基化辅助下的脑室下区GBM新型分类法(SVZM)。该新型分类法补充当前基于MRI的分类内容,使患者肿瘤分类更准确,可以更精准预测预后;在检测肿瘤起源细胞方面显示,通过DNA-甲基组分析保留表观遗传指标比单一转录组分析更有优势。
在脑室下区的GBM新型分类法中,发现与免疫功能密切相关的MAB21L2/LRBA嵌套基因。结合相关研究,这些基因与TGFβ通路活性、免疫失调、肿瘤免疫微环境密切相关。其表观遗传和转录沉默可能与观察到的脑室下区GBM较差预后相关。
研究结论