2022年01月12日发布 | 1258阅读
肿瘤
EBV相关的中枢神经系统淋巴瘤

郭莉丽

神介编译投稿作者

gaom

编译文章投稿作者

花玮

复旦大学附属华山医院

达人收藏




































































































































澳大利亚布里斯班昆士兰大学的M. K. Gandhi等采用靶向测序和数字复合基因表达等方法比较91例PCNSL的组织遗传全景和肿瘤微环境;文章发表于2021年3月《Blood》杂志。


——摘自文章章节

Ref: Gandhi MK, et al. Blood. 2021 Mar 18;137(11):1468-1477. doi: 10.1182/blood.2020008520.


研究背景




原发性中枢神经系统淋巴瘤(primary central nervous system lymphoma,PCNSL)一般局限于大脑、眼和脑脊液等,多无全身播散的迹象。少部分发生在免疫抑制的情况下,如器官移植后的淋巴增生性疾病或艾滋病的PCNSL,预后很差,尤其是与EB病毒(EBV)相关的PCNSL。澳大利亚布里斯班昆士兰大学(UQ)的M. K. Gandhi等采用靶向测序和数字复合基因表达等方法比较91例PCNSL的组织遗传全景和肿瘤微环境(TME);文章发表于2021年3月《Blood》杂志。


研究方法



91例福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的患者样本组织都具有弥漫性大B细胞淋巴瘤组织学特征。EBV和HIV病毒检测发现,其中47例EBV阴性:45例EBV- HIV- PCNSL和2例EBV- HIV+ PCNSL;44例EBV阳性:23例EBV+ HIV+ PCNSL和21例EBV+ HIV- PCNSL。按PCNSL亚型分组见图1。


图1. 根据EBV组织和HIV血清特征的PCNSL突变全景。A.每一列代表79个最终测序有基因突变的一个案例,涉及4组亚型:EBV- HIV- PCNSL、EBV- HIV+ PCNSL、EBV+ HIV+ PCNSL和EBV+ HIV- PCNSL;B.直方图显示3个主要亚型中MYD88、CD79B和PIM1突变比率;C.利用靶向测序观察EBV- HIV- PCNSL、EBV+ HIV+ PCNSL和EBV+ HIV- PCNSL的突变基因数量,配对亚型的P值。


研究者检测MYD88、CD79B和PIM1突变,并比较检测到的突变基因总数。EBV- HIV- PCNSL主要类型为活化B细胞(ABC),占69%;HLA I/II等位基因拷贝数(CN)的变化见图2。


图2. HLA I/II类等位基因和抗原提呈/加工基因的分子COO和拷贝数改变,分列为PCNSL亚型。A.堆叠直方图显示3个亚型的分子COO分类之间的关系;B.每一列代表跨越4个PCNSL亚型的一个案例。


研究在排除仅1例的EBV- HIV+ PCNSL后,识别3个主要PCNSL亚型的模式;比较按信号通路分类的突变或拷贝数缺失,结果发现EBV阳性PCNSL与EBV- HIV- PCNSL相比具有明显的分子特征改变。为描述此3个PCNSL亚型之间的肿瘤维环境(TME)差异,研究者使用定制的免疫基因芯片进行数字基因表达分析;结果显示,众多重要的免疫相关基因表达有差异。同时探索EBV阳性PCNSL在免疫抑制中的发病机制及潜在的免疫治疗可行性(图3)。


图3. EBV阳性PCNSL对免疫抑制的发病机制及免疫治疗有潜在意义。A.EBV- HIV- PCNSL中,NF-κB和细胞循环途径的改变和HLA I/II类分子缺失;B.EBV阳性PCNSL的病毒转化,失去宿主免疫提供的无选择压力阻止HLA I/II类分子表达EBV免疫原性肽;C.EBV病毒特异性T细胞(VST)穿过血脑屏障靶向EBV+恶性B细胞。


结论



该研究结果指出,EBV-HIV-PCNSL中,MYD88、CD79B和PIM1突变频率较高,并富集活化B细胞(ABC)的原始亚型。这些突变在所有EBV阳性PCNSL中均不存在,ABC频率较低。而且,HLA I/II类和抗原呈递/处理基因拷贝数丢失在EBV阳性PCNSL中很少见,表明抗原呈递能力的保留。EBV+ HIV- PCNSL具有耐受肿瘤微环境的特征;巨噬细胞和免疫检查点基因表达升高,而HIV相关PCNSL的CD4基因计数降低。EBV相关PCNSL在免疫特征上与EBV- HIV- PCNSL有很大不同,仍保留针对EBV抗原的呈递能力。


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