多点测序结合ctDNA检测有助于GBM的分子诊断 - 脑医汇 - 神外资讯

天津医科大学总医院神经外科的康春生等对11例胶质母细胞瘤患者进行多点测序和循环系统肿瘤DNA检测，发现ctDNA检测结果与肿瘤组织的多点外显子测序结果相吻合，论文发表在2019年12月的《Aging》在线。

——摘自文章章节

【Ref: Yang C, et al. Aging (Albany NY). 2019 Dec 10;11(23):11224-11243. doi: 10.18632/aging.102526. Epub 2019 Dec 10.】

研究背景

胶质母细胞瘤（GBM）是一类侵袭性极强的恶性脑肿瘤，具有高度肿瘤内异质性。了解胶质母细胞瘤的肿瘤异质性有助于克服肿瘤的放疗抵抗、控制肿瘤进展和复发。天津医科大学总医院神经外科的康春生等对11例胶质母细胞瘤患者进行多点测序和循环系统肿瘤DNA（ctDNA）检测，发现ctDNA检测结果与肿瘤组织的多点外显子测序结果相吻合，论文发表在2019年12月的《Aging》在线。

研究方法

作者首先对11例胶质母细胞瘤患者（包括1例患者的原发和复发的肿瘤样本）的31个基因进行外显子测序，以确定胶质母细胞瘤的遗传基础和肿瘤内异质性。研究者在分析最常见的50个体细胞突变时，发现MUC16基因在所检测的样本中突变率最高（19/31）。同时发现其它已知的驱动基因，包括EGFR、PTEN和TP53等的突变基因富集于双链DNA损伤修复、组蛋白修饰和磷酸化修饰的信号通路中（图1）。

图1. 胶质母细胞瘤的驱动基因突变分析。

接着，为研究胶质母细胞瘤的遗传进化，作者对1例原发和复发配对的GBM进行肿瘤进化分析，发现原发与复发肿瘤样本的每个部位都检测到多个亚克隆，但突变基因和突变频率在肿瘤的不同部位有所区别（图2）。

图2. 1例患者的原发和复发GBM样本的进化分析。

最后，研究分析血液ctDNA中的1403个基因。既往研究报道这些基因在肿瘤发生和肿瘤进展中起重要作用。通过ctDNA测序数据和11例GBM患者的肿瘤组织外显子测序结果与TCGA基因突变数据库进行比较，发现ctDNA测序可以检测到GBM肿瘤中的常见基因突变，并获得在肿瘤组织样本中无法检测的其它基因突变信息（图3）。

图3. ctDNA与肿瘤的EGFR测序结果比较。

结论

作者指出，该研究证实对胶质母细胞瘤进行多点外显子测序与循环系统肿瘤DNA检测的结果相吻合，表明可以将血液样本的ctDNA检测作为体液活检，帮助诊断胶质母细胞瘤。

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