在H3.3 K27M细胞中,随着H3K27me3的全局性减少,具有“H3K27me3和H3K27ac双价”启动子的基因可由稳定状态转化为活跃状态,因此,与H3野生型相比此类基因表达增加。
——摘自文章章节
【Ref: Larson JD, et al. Cancer Cell. 2019 Jan 14;35(1):140-155.e7. doi: 10.1016/j.ccell.2018.11.015. Epub 2018 Dec 27.】
研究背景
弥漫性内生性桥脑胶质瘤(diffuse intrinsic pontine gliomas,DIPG)是一类难治性儿童脑干肿瘤,占儿童高级别胶质瘤的一半以上;6岁至8岁是发病高峰年龄段。组蛋白H3的体细胞突变可作为儿童和成人高级别胶质瘤独特的分子标志物,其中组蛋白H3 K27M突变型出现在80%以上的DIPG以及起源于大脑中线结构的高级别胶质瘤,如丘脑胶质瘤。因此,H3K27M突变型已列入新的WHO中枢神经系统肿瘤的分类系统中。美国孟菲斯圣犹大儿童研究医院发育神经生物学系的Jon D. Larson等在小鼠不同脑区表达组蛋白H3.3 K27M突变,研究H3K27me3的表达耗竭后的表观遗传学调节方式的变化,进而明确转录改变与致癌活性之间的关系。结果发表在2018年12月《Cancer Cell》在线上。
研究方法
研究者在转基因小鼠的胎鼠神经系统中,条件性突变组蛋白H3,获得H3.3 K27M阳性表型的前脑和后脑神经干细胞或祖细胞。进行体外分析时,发现H3.3 K27M的表达可以提高神经干细胞或祖细胞的自我更新能力;H3K27me3的耗竭仅导致部分散在的基因转录发生改变,在这些基因位点的启动子区域H3K27me3出现变化。但H3.3 K27M未能影响前脑和后脑神经干细胞或祖细胞的区域表达特征,故对神经发育并未产生影响。
研究结果
H3.3 K27M加速神经干细胞或祖细胞的增殖和自我更新,但无法诱导脑肿瘤的发生。研究人员在小鼠神经干细胞或祖细胞H3.3 K27M突变基础上,附加P53的缺失突变,获得髓母细胞瘤和幕上高级别胶质瘤(HGG)的表型,并在组织学和细胞学上得到证实。血小板衍生生长因子受体α(platelet-derived growth factor receptor α,PDGFRα)是儿童HGG中最常发生突变的酪氨酸激酶受体,与肿瘤的发生发展有密切的关系。后续的动物实验证实,P53缺失与PDGFRA(即DIPG中PDGFRα最常见的突变类型)的表达可加速HGG的发生,显著提高脑干肿瘤的发生率。同样,研究人员在神经干细胞或祖细胞H3.3 K27M加P53缺失加PDGFRA表型的小鼠内,发现H3.3 K27M显著增加HGG的发生率,而且脑干部位的弥慢浸润生长的HGG发生率增加到95%,其组织病理学与人类DIPG极为相似。在基因表达层面,通过基因位点富集分析(GSEA)的方法证实,基因工程小鼠自发形成的表达H3.3 K27M的DIPG与人类表达H3.3 K27M的DIPG非常相似。在表观遗传学层面上,H3.3 K27M的表达,大幅度改变H3 K27M位点的转录后修饰方式,导致H3K27me3全局性减少,而H3K27ac则更明显,从而出现基因表达的差异,促进肿瘤的发生发展。
在H3野生型DIPG中,待表达基因的启动子在相同或邻近的核小体上,同时携带H3K27me3和H3K4me3翻译后的修饰区。其中一些基因的启动子似乎在不同的H3 野生型细胞(或同一细胞内的不同等位基因)中表现出稳定或活跃的双重状态;基因表达分析显示,H3K27me3和H3K27ac均出现在这些基因的启动子区域中。在H3.3 K27M细胞中,随着H3K27me3的全局性减少,具有“H3K27me3和H3K27ac双价”启动子的基因可由稳定状态转化为活跃状态,因此,与H3野生型相比此类基因表达增加。
结论
研究结果表明,H3.3 K27M在不诱导神经干细胞永生化的情况下,增强神经干细胞的自我更新能力,并加速髓母细胞瘤或后脑HGG的发生。H3.3 K27M可能诱导 “H3K27me3和H3K27ac双价”启动子调控的基因表达上调,进而导致部分与发育和肿瘤发生相关的基因转录改变。如果细胞在一个狭窄的发育窗口中获得肿瘤相关的关键突变,可能形成易于转化为DIPG的细胞群。由于细胞的表观遗传学状态与其发育和分化有着极强的相关性,因此H3.3 K27M依赖的关键突变与DIPG的起始年龄和精确的细胞状态有着密切联系,这也为DIPG的异质性特征提供理论基础。