2019年01月28日发布 | 742阅读

脑和脊髓AVM患者体细胞中高表达KRAS/BRAF突变

颜华

宁夏医科大学总医院

脑和脊髓动静脉畸形(AVM)是引发颅内出血或永久性残疾的先天性疾病。有研究表明,AVM可能与以种系突变为特征的遗传综合征相关,遗传性出血性毛细血管扩张症中的TGF-β/SMAD通路突变、毛细血管-动静脉畸形综合征中的Rasa 1基因突变均属种系突变。另有研究表明,散发性脑脊髓血管畸形与体细胞突变而非种系突变相关。

——摘自文章章节

【Ref: Hong T, et al. Brain . 2019 Jan 1;142(1):23-34. doi: 10.1093/brain/awy307.】


研究背景


脑和脊髓动静脉畸形(AVM)是引发颅内出血或永久性残疾的先天性疾病。有研究表明,AVM可能与以种系突变为特征的遗传综合征相关,遗传性出血性毛细血管扩张症中的TGF-β/SMAD通路突变、毛细血管-动静脉畸形综合征中的Rasa 1基因突变均属种系突变。另有研究表明,散发性脑脊髓血管畸形与体细胞突变而非种系突变相关。北京首都医科大学宣武医院神经外科的Tao Hong等运用包含422个肿瘤基因的超基因组新一代测序(next generation sequencing,NGS)研究脑和脊髓动静脉畸形是否可检测到与肿瘤相关的体细胞突变,结果发表在2019年1月的《Brain》上。



研究方法


作者将21例脑AVM和10例脊髓AVM患者手术切除的畸形血管团,制成标本。从组织标本中提取基因组DNA,进行NGS和微滴数字聚合酶链反应(droplet digital polymerase chain reaction,ddPCR)分析,并与全血标本进行比对。



研究结果


结果表明,平均测序深度为1077±298X。31例患者AVM组织标本中,检测到21例携带KRAS突变,2例携带BRAF突变。配对的全血样本中,均未检测到相应突变。除RAS/RAF信号通路基因突变外,2例以上的AVM组织标本中未发现其它基因突变。检测KRAS基因时,发现5个单核苷酸错义变异和1个插入变异,变异频率(variant frequencies,VF)从0.13%~8.82%。在密码子12处检测到KRAS突变:c.35G>A p.Gly12Asp、c.35G>T p.Gly12Val、c.34G>T p.Gly12Cys和c.35G>C p.Gly12Asp;密码子61处:c.183A>T p.Gln61His;密码子66处:c.191_196dupACAGTG p.S65_Ala66insAspSer。在1例脑AVM和1例脊髓AVM中检测到BRAF突变:c.1799T>A p.Val600Glu。


作者用ddPCR证实从NGS中检测到的21个KRAS和2个BRAF突变;并在8个外显子组测序阴性标本中检测到另外4个KRAS突变。该研究中,KRAS/BRAF突变的总流行率为87.1%。ddPCR检测突变的变异频率为0.03%~7.29%。ddPCR检测的变异频率与基于NGS方法检测的变异频率相关性较强(r=0.950,P<0.001)。变异频率与脑和脊髓AVM的最大径、畸形血管团体积呈负相关,与患者年龄无相关性(图1)。KRAS/BRAF突变在脑AVM中占81.0%,在脊髓AVM中占100%。NGS和ddPCR结果均显示,脑和脊髓AVM在KRAS和BRAF中具有相同的突变模式。KRAS p.G12D和p.G12V在脑和脊髓中均为突变热点,在脊髓AVM为30.0%和30.0%,在脑AVM中为52.4%和19.0%。而BRAF p.V600E罕见,仅在1例脑AVM和1例脊髓AVM患者中发现。


图1. A.变异频率(VF)与脊髓AVM最大径呈负相关(r=0.764;P=0.010);B.变异频率与脊髓AVM 畸形血管团体积呈负相关(r=0.686;P=0.028);C.变异频率与脑AVM最大径呈负相关(r=0.524;P=0.037);D.变异频率与脑AVM 畸形血管团体积呈负相关(r=0.522;P=0.038);E.变异频率与患者年龄无关(r=0.338;P=0.085)。



结论


该研究支持在绝大多数脑和脊髓AVM中,存在由KRAS/BRAF介导体细胞突变的致病机制的理论。AVM诊断可不依赖于组织遗传学。更重要的是AVM中的不同通路突变,成为RAS/RAF/MAPK通路抑制剂靶向治疗发展的主要障碍。


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