苏州大学附属第一医院神经外科始建于1959年，是国内最早开展脑血管病、颅脑外伤、颅内肿瘤、脑脓肿、脊髓肿瘤、先天畸形等手术的单位之一。1972年神经外科拥有的手术显微镜属国内首次引进，脑动脉瘤夹、双极电凝器、脑室-腹腔引流管器械在当时均为国内空白，同年，科室成立了国内最早的脑神经研究室，并配备5万转超速离心机。1983年培养成功中国第一株人脑胶质瘤体外细胞系SHG-44，又相继建立了我国第一个人脑胶质瘤裸小鼠膜型NHG-1、抗人脑胶质瘤单克隆抗体杂交瘤细胞系SZ38、SZ39，这些研究都达到当时国际先进水平。

1981年11月，苏大附一院神经外科成为国务院学位委员会首批在全国授予的硕士、博士点。在鲍耀东、杜子威、惠国桢、周岱、朱凤清、张世明等教授的带领下，科室已成为卫生部华东地区首批进修医师培训基地（1982年）、江苏省卫生厅医学重点学科（1997年）、江苏省唯一的国家临床重点专科建设单位（2013年）、苏州市临床医学中心（2015年）、江苏省临床医学中心（创新平台）共建单位（2016年）、中国医师协会神经内镜医师培训基地（2019年），江苏省医学会神经外科分会候任主委单位，同时还是江苏省神经外科医疗质量控制中心所在单位、首批认定的国家级神经外科专科医师培训基地。

苏大附一院神经外科现有床位168张，4个病区，3个重症监护病房，二期建设共规划232张床位，其中重症ICU床位24张，预计于2023年建成。共有医生 47名，护理人员 91 名，TCD人员 16名，实验室专职研究员7名，博导10人、硕导22人，年诊疗人次超过3.2万、收治患者5000余例、手术病人3600余例。目前已形成了颅内动脉瘤破裂急性期超早期眶上外侧入路微创手术治疗、动脉瘤性蛛网膜下腔出血（SAH）的基础研究、脑中线深部肿瘤及颅底外科的解剖与临床研究、垂体瘤的外科治疗与基础研究、胶质瘤的外科治疗与基础研究、创伤性脑损伤的外科治疗与转化医学研究等主要学科技术特色与优势，其中多项新技术填补了省内的医疗空白，达到国内外先进水平。

近5年来，科室科技影响力连续位于全国前20位，最高排名达全国第6。共获得各类课题48项，其中国家级课题23项，国际(地区)合作与交流项目1项，国家科技资源共享服务平台计划1项；部省级项目10项；市厅级项目13项；获得各类科技奖项共19项，包括江苏省科学技术一等奖2项，江苏省医学科技二等奖1项，江苏省科学技术三等奖1项。发表SCI、核心期刊（北图）和中国科学技术信息中心统计源期刊发表论文数量达到 240余篇。有“青年长江学者”1人（2016），“中组部万人计划科技创新领军人才”1人（2019）。

目前科室共有脑（脊髓）血管病、颅底肿瘤、胶质瘤、后颅底与脊髓脊柱、功能神经外科、垂体瘤及鞍区肿瘤、神经重症与颅脑创伤、神经内镜八个亚专业组，对神经外科疾病进行全方位专业治疗。